株式会社ダナフォーム


Eprobe®/Eprimer™のカスタム合成サービス

Eprobe®/Eprimer™について

Eprobe®/Eprimer™は、ダナフォームが理化学研究所と共同開発した新規蛍光プローブです。この蛍光プローブは、1本鎖の状態では消光していますが、相補鎖と特異的にハイブリダイズすることにより蛍光を発するため、PCR法やSmartAmp®法に適用すると、極めてシャープに目的の核酸配列を検出できます。

ダナフォームでは、Eprobe®/Eprimer™のカスタム合成を承っています。Eprobe® PCR用試薬「E-Taq 2xPCR Mix」や「E-Taq DNA Polymerase」と合わせてご活用ください。

Eprobe®/Eprimer™の特徴

  • 1. 特異的なハイブリダイゼーションによる蛍光検出が可能。
  • 2. リアルタイムPCR検出・融解曲線解析が1本のプローブで可能。

Eprobe®/Eprimer™のアプリケーション

  • 1. SNP解析
  • 2. 微量体細胞変異解析
  • 3. 定量PCR法
  • 4. SmartAmp®法などの等温核酸増幅法

使用例1: 融解曲線を利用した1プローブSNP解析

Eprobe® PCR後の融解曲線解析において、野生型の塩基配列に完全一致で結合したEprobe®とミスマッチをもつ変異型の塩基配列に結合したEprobe®では、融解温度(Tm)に差が生じることになります。この差を解析することで1プローブのみで変異型の有無を調べることが可能になります。Eprobe®は未標識オリゴDNAに比べTm値が約10℃高いため、プローブ長を短くでき、1塩基置換のTm差がより顕著に出ます。



Eprobe®による融解曲線解析の原理

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1プローブSNPの解析例

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使用例2: PCRクランピングを利用した微量体細胞変異検出

プライマーと座位を共有し、プライマーより強く野生型配列に結合するEprobe® を加えてPCRを行うことで、野生型配列の増幅を阻害し、体細胞変異由来の配列を効率よく増幅させる(PCRクランピング)ことが可能です。



Eprobe®によるPCRクランピング法の原理

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SmartAmp®を用いた体細胞変異の解析例

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*いずれも配列情報に基づいて人工合成したDNAを鋳型鎖として利用しています。


製品について

製品仕様/各製品共通

項目 出荷規格 規格外の対応
純度 HPLC(%) 90%以上 再合成
質量数 MALDI-TOFMS(Da) 目的配列の質量数を確認 再合成
保証期間 HPLC(%) 冷凍(-20℃)、遮光保存3カ月 3カ月以内にHPLC(%)の低下が確認された場合には再合成
精製方法 HPLC精製 HPLC精製以外の設定はなし
納品形態 乾燥品(常温輸送) 溶液品希望の時は別途見積り
備考 使用用途 研究用試薬
診断、その他の目的には使用できない
保証外

※純度:配列およびその他の事由により90%を保証できない可能性があります。
あらかじめご了承ください。

出荷形態

乾燥品、1.5もしくは2.0mLチューブ

カスタム合成に関する注意事項

  • Dye標識塩基は「T」のみです。
  • Dyeの標識は1箇所のみです。
  • Dyeの種類はチアゾールオレンジ(励起/蛍光:510/530)、チアゾールピンク(570/590)の2種類です。
  • Dyeを5’末端・3’末端より3塩基以内に標識した場合には、色調の異常・使用時のベースシグナルの上昇等が発生し、反応・検出などに影響が出る場合があります。位置の例: 5’-ZAGCAGC…、5’-AZCCGCA…、5’-AGZCGA…、…AGCZGC-3’、…CGAZG-3’(Z: Dye標識されたT)
  • Dyeの位置決定については、必要に応じてご相談ください。
  • 特別仕様品(要相談品)

特別仕様品(要相談品)

バルクスケール;11nmol以上保証

鎖長26mer以上50mer未満


Eprobe®, Eprimer™ の納期

検出波長 保証収量 精製 ※納期
チアゾールオレンジ
Eprobe/Eprimer
励起波長
510nm
蛍光波長
530nm
1.5nmol
3nmol
5nmol
10nmol
OPC+HPLC 5営業日
チアゾールピンク
Eprobe/Eprimer
励起波長
570nm
蛍光波長
590nm
1.5nmol
3nmol
5nmol
10nmol
OPC+HPLC 7営業日



注意事項

  • 本製品は試験研究用です。
  • 本試薬は株式会社ダナフォームと理化学研究所の共同研究で開発されたもので特許取得済みです。
  • ※納期 : 受注日の翌日から発送までの日数。
    [合成状況により変動する可能性があります]
    10本以上の同時ご注文場合には、別途納期をお見積りいたします。
  • ※その他 : 配列、修飾種類により純度、収量が保証できないことがあります。
    あらかじめご了承ください。


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