Xenopus Gene Collection：製品概要
□ Xenopus Gene Collectionプロジェクト
Xenopus Gene Collection (XGC)は NIH主導のプロジェクトで、Mammalian Gene Collectionのサブプロジェクトとして行われています。 高品質のcDNAライブラリーを入手または作製し、5' 末端解析によるスクリーニング、完全なORFが含まれていると思われるクローンの同定が行われ、 選ばれたクローンの全塩基配列が決定されました。本プロジェクトは、Xenopus laevisとXenopus tropicalisの完全長cDNAクローンのコンプリートセットを提供することを目的としています。
XGCプロジェクトは以下の様に進められます。
- □それぞれの発生過程または成獣組織からライブラリーを作製しています。
- □それぞれのライブラリーから3,000から10,000クローンの、5' /3' EST解析を行います。
- □全塩基配列をGenBankへ登録し、I.M.A.G.E.として提供しています。
- □UniGene clustersに登録されている全既知配列との比較解析を行います。
- □完全なORFを含んでいる可能性があるクローンを選定し、全長塩基配列の決定を行います。
XGCクローンは下記ように整理されています。
- □I.M.A.G.E. ID（dbESTのESTファイルを参照する場合）
- □MGC ID（GenBankでインサートの全塩基配列を参照する場合）
□配列解析済み完全長XGCクローンのリアレイプレート一覧
| プレートの頭文字 | 由来種 | ベクターの耐性 |
|---|---|---|
| IRBH | X. laevis | Ampicillin |
| IRBG | X. laevis | Chloramphenicol |
| IRBN | X. tropicalis | Ampicillin |
Subsetに含まれているクローンは、使われているベクターによってプレートが分かれています。 そのため、同じプレートにあるクローンには全て同じベクター（IRBH, IRBG, IRBN）が使われています。 ベクターの詳細についてはI.M.A.G.E.ベクター情報一覧をご覧下さい。
The I.M.A.G.E. Consortiumのホームページで公開されているquery toolでは、MGCクローンに関する、 『IMAGE ID, MGC_ID, species, vector, rearray clone location, Genbank Accession number, Unigene Cluster Number, GenBank definition line, gene symbol』等の最新情報が公開されています。
目的のクローンのIMAGE IDを調べる場合はI.M.A.G.E. IDの検索方法をご参考下さい。
最近、リアレイしたライブラリーのシークエンス解析がThe I.M.A.G.E. Consortiumで行われ、QC統計データが作成されました。
これら3つのSubsetに含まれるクローンは個別クローン単位（寒天培地に植菌）、または96wellプレート単位（大腸菌グリセロールストック）でのご注文も可能です。
クローンはI.M.A.G.E.クローンと同様、I.M.A.G.E. IDでご注文ください。XGC Subsetに含まれるクローンの一部を注文された場合、 プレート（IRBH, IRBG, IRBN）からクローンを植菌してお渡ししております。もしご注文のクローンにXGC_IDが割り振られているにもかかわらず、 まだSource BioScience社でSubsetプレートとして受け取りを完了していない場合は、Source BioScienceで保管しているI.M.A.G.E. Collectionから同じクローンを植菌し、出荷致します。
現在お求めいただける全XGC Subsetの一覧はXenopus Gene Collection一覧でご確認いただけます。