MGCクローン : 製品概要
□ Mammalian Gene Collectionプロジェクト
Mammalian Gene Collection (MGC)は NIH 主導のプロジェクトです。 このプロジェクトは、ヒト、ラット、マウス、ウシの完全長cDNAクローンのコンプリートセットを提供することを目的としています。
MGCプロジェクトは以下の様に進められます。
- □完全長cDNAのライブラリーを作製します。
- □全てのライブラリーからそれぞれ768クローンの5’と3’末端のシークエンス解析をし、ライブラリーの評価を行います。
- □ライブラリーの評価に従い、10,000から30,000クローンの5’末端シークエンス解析を行います。これらのクローンにはI.M.A.G.E. IDが与えられ、I.M.A.G.E.リソースとなります。
- □N末端をコードしていると考えられるクローンを特定するために、いくつかの法則に従い５’のシークエンス解析を行います。 特定したクローンはLLNLのI.M.A.G.E. Consortiumが384wellプレートにリアレイします。 I.M.A.G.E. web siteではこれらのプレートの頭文字にIRAKやIRAL、IRAMと表記しており、クローン毎にそれぞれ固有のI.M.A.G.E. IDを割り振っています。
- □全ORFを含んでいると確認されたクローンにのみ、I.M.A.G.E. IDに加えて固有のMGC ID（例：MGC_15287またはMGC:15287）が割り振られます。これらの塩基配列はGenBankに登録されています。
- □MGC IDをつけられているクローンを96wellプレートに移します。
MGCクローンは以下の様に整理されています。
- □I.M.A.G.E. ID（dbESTのESTファイルを参照する場合）
- □MGC ID（GenBankでインサートの全塩基配列を参照する場合）
□配列解析済み完全長MGCクローンのリアレイプレート一覧
| プレートの頭文字 | 由来種 | ベクターの耐性 | プレート番号 |
|---|---|---|---|
| IRAT | Human | Ampicillin 50μg/ml | 1-89, 93-137 |
| IRAU | Human | Chloramphenicol 27μg/ml | 1-114 |
| IRCM | Human | Kanamycin 30μg/ml | 1-25, 27-39 |
| IRAV | Mouse | Ampicillin 50μg/ml | 1-84, 87-136, 139-152, 155-168 |
| IRAW | Mouse | Chloramphenicol 27μg/ml | 1-9 |
| IRCL | Mouse | Kanamycin 30μg/ml | 1 |
| IRBP | Rat | Ampicillin 50μg/ml | 1-53 |
| IRBQ | Rat | Chloramphenicol 27μg/ml | 1-3 |
| IRCJ | Cow | Ampicillin 50μg/ml | 1-39 |
I.M.A.G.E. Consortiumにより作成されたQC統計データはこちらでご確認頂けます。
□http://www.imageconsortium.org/?pageID=16
Subsetに含まれるクローンは個別クローン単位（寒天培地に植菌）、または96wellプレート単位（大腸菌グリセロールストック）でのご注文も可能です。
クローンはI.M.A.G.E.クローンと同様、I.M.A.G.E. IDでご注文ください。 MGC Subsetに含まれるクローンの一部を注文された場合、プレートからクローンを植菌してお渡ししております。 もしご注文のクローンにMGC IDが割り振られているにもかかわらず、まだSource BioScience社でSubsetプレートとして受け取りを完了していない場合は、 Source BioScienceで保管しているI.M.A.G.E. Collectionから同じクローンを植菌し、出荷致します。