The Zebrafish Gene Collection

Zebrafish Gene Collection (ZGC)は NIH主導のプロジェクトで、Mammalian Gene Collectionのサブプロジェクトとして行われています。高品質のcDNAライブラリーを入手または作製し、5' 末端解析によるスクリーニング、完全なORFが含まれていると思われるクローンの同定が行われ、選ばれたクローンの全塩基配列が決定されました。本プロジェクトは、Zebrafishの完全長cDNAクローンのコンプリートセットを提供することを目的としています。

ZGCプロジェクトは以下の段階により進められています。

• まず3ヶ月程度をかけ、様々なライブラリーから、クローンの5' 末端配列を集められます。
• その後、多くの研究者による会議で、全長塩基配列を決定するクローンリストの検討が行われます。
• これらの作業が3ヶ月ごとに繰り返し行われます。
• 加えて、完全長と推定されるクローンを有する研究者と共同で、それらのクローンの全長塩基配列決定を行います。

ZGCクローンは下記ように整理されています。

• I.M.A.G.E. ID（dbESTのESTファイルを参照する場合）
• MGC_ID（GenBankでインサートの全塩基配列を参照する場合）

配列解析済み完全長ZGCクローンのリアレイプレート一覧

Subsetに含まれているクローンは、使われているベクターによってプレートが分かれています。そのため、同じプレートにあるクローンには全て同じベクター（IRBV, IRBO）が使われています。ベクターの詳細についてはI.M.A.G.E.ベクター情報一覧をご覧下さい。

最近、リアレイしたライブラリーのシークエンス解析がThe I.M.A.G.E. Consortiumで行われ、QC統計データが作成されました。

このSubsetに含まれるクローンは個別クローン単位（寒天培地に植菌）、または96wellプレート単位（大腸菌グリセロールストック）でのご注文も可能です。

クローンはI.M.A.G.E.クローンと同様、I.M.A.G.E. IDでご注文ください。ZGC Subsetに含まれるクローンの一部を注文された場合、プレート（IRBV, IRBO）からクローンを植菌してお渡ししております。もしご注文のクローンにZGC_IDが割り振られているにもかかわらず、まだSource BioScience社でSubsetプレートとして受け取りを完了していない場合は、Source BioScienceで保管しているI.M.A.G.E. Collectionから同じクローンを植菌し、出荷致します。

現在お求めいただける全ZGC Subsetの一覧はZebrafish Gene Collection一覧でご確認いただけます。

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