The Xenopus Gene Collection

Xenopus Gene Collection (XGC)は NIH主導のプロジェクトで、Mammalian Gene Collectionのサブプロジェクトとして行われています。高品質のcDNAライブラリーを入手または作製し、5' 末端解析によるスクリーニング、完全なORFが含まれていると思われるクローンの同定が行われ、選ばれたクローンの全塩基配列が決定されました。本プロジェクトは、Xenopus laevisとXenopus tropicalisの完全長cDNAクローンのコンプリートセットを提供することを目的としています。

XGCプロジェクトは以下の様に進められます。

• それぞれの発生過程または成獣組織からライブラリーを作製しています。
• それぞれのライブラリーから3,000縲鰀10,000クローンの、5' /3' EST解析を行います。
• 全塩基配列をGenBankへ登録し、I.M.A.G.E.として提供しています。
• UniGene clustersに登録されている全既知配列との比較解析を行います。
• 完全なORFを含んでいる可能性があるクローンを選定し、全長塩基配列の決定を行います。

XGCクローンは下記ように整理されています。

• IMAGE ID（dbESTのESTファイルを参照する場合）
• MGC_ID（GenBankでインサートの全塩基配列を参照する場合）

配列解析済み完全長XGCクローンのリアレイプレート一覧

Subsetに含まれているクローンは、使われているベクターによってプレートが分かれています。そのため、同じプレートにあるクローンには全て同じベクター（IRBH, IRBG, IRBN）が使われています。ベクターの詳細についてはI.M.A.G.E.ベクター情報一覧をご覧下さい。

最近、リアレイしたライブラリーのシークエンス解析がThe I.M.A.G.E. Consortiumで行われ、QC統計データが作成されました。

これら3つのSubsetに含まれるクローンは個別クローン単位（寒天培地に植菌）、または96wellプレート単位（大腸菌グリセロールストック）でのご注文も可能です。

クローンはI.M.A.G.E.クローンと同様、I.M.A.G.E. IDでご注文ください。XGC Subsetに含まれるクローンの一部を注文された場合、プレート（IRBH, IRBG, IRBN）からクローンを植菌してお渡ししております。もしご注文のクローンにXGC_IDが割り振られているにもかかわらず、まだSource BioScience社でSubsetプレートとして受け取りを完了していない場合は、Source BioScienceで保管しているI.M.A.G.E. Collectionから同じクローンを植菌し、出荷致します。

現在お求めいただける全XGC Subsetの一覧はXenopus Gene Collection一覧でご確認いただけます。

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