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MGCクローン

ダナフォーム本社
Tel: 045-510-0607

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Mammalian Gene Collection (MGC)は NIH 主導のプロジェクトです。このプロジェクトは、 ヒト、ラット、マウス、ウシの完全長cDNAクローンのコンプリートセットを提供することを目的としています。

MGCプロジェクトは以下の様に進められます。

  • 完全長cDNAのライブラリーを作製します。
  • 全てのライブラリーからそれぞれ768クローンの5’と3’末端のシークエンス解析をし、ライブラリーの評価を行います。
  • ライブラリーの評価に従い、10,000縲鰀30,000クローンの5’末端シークエンス解析を行います。これらのクローンにはI.M.A.G.E. IDが与えられ、I.M.A.G.E.リソースとなります。
  • N末端をコードしていると考えられるクローンを特定するために、いくつかの法則に従い5’のシークエンス解析を行います。特定したクローンはLLNLのI.M.A.G.E. Consortiumが384wellプレートにリアレイします。I.M.A.G.E. web siteではこれらのプレートの頭文字にIRAKやIRAL、IRAMと表記しており、クローン毎にそれぞれ固有のI.M.A.G.E. IDを割り振っています。
  • 全ORFを含んでいると確認されたクローンにのみ、I.M.A.G.E. IDに加えて固有のMGC ID(例:MGC_15287またはMGC:15287)が割り振られます。これらの塩基配列はGenBankに登録されています。
  • MGC IDをつけられているクローンを96wellプレートに移します。

MGCクローンは以下の様に整理されています。

  • I.M.A.G.E. ID(dbESTのESTファイルを参照する場合)
  • MGC ID(GenBankでインサートの全塩基配列を参照する場合)

配列解析済み完全長MGCクローンのリアレイプレート一覧

プレートの頭文字 由来種 ベクターの耐性 プレート番号
IRAT Human Ampicillin 50μg/ml 1-89, 93-137
IRAU Human Chloramphenicol 27μg/ml 1-114
IRCM Human Kanamycin 30μg/ml 1-25, 27-39
IRAV Mouse Ampicillin 50μg/ml 1-84, 87-136, 139-152, 155-168
IRAW Mouse Chloramphenicol 27μg/ml 1-9
IRCL Mouse Kanamycin 30μg/ml 1
IRBP Rat Ampicillin 50μg/ml 1-53
IRBQ Rat Chloramphenicol 27μg/ml 1-3
IRCJ Cow Ampicillin 50μg/ml 1-39

> MGCクローン:ベクター情報

I.M.A.G.E. Consortiumにより作成されたQC統計データはこちらでご確認頂けます。
> http://image.hudsonalpha.org/qc/html/QCoverall.shtml

Subsetに含まれるクローンは個別クローン単位(寒天培地に植菌)、または96wellプレート単位(大腸菌グリセロールストック)でのご注文も可能です。

クローンはI.M.A.G.E.クローンと同様、I.M.A.G.E. IDでご注文ください。MGC Subsetに含まれるクローンの一部を注文された場合、プレートからクローンを植菌してお渡ししております。もしご注文のクローンにMGC IDが割り振られているにもかかわらず、まだSource BioScience社でSubsetプレートとして受け取りを完了していない場合は、Source BioScienceで保管しているI.M.A.G.E. Collectionから同じクローンを植菌し、出荷致します。